Os lixiviados provenientes do Aterro são captados e encaminhados através de condutas para duas lagoas que se localizam a sul da Unidade de Tratamento Mecânico e Biológico, onde são armazenados para posterior tratamento na ETAL.
Os lixiviados passam então pelo sistema de Tratamento Biológico e um sistema de Ultrafiltração, com as seguintes etapas:
Através deste tratamento, o lixiviado bruto é devidamente tratado, antes de ser descarregado no coletor de saneamento.